Humm...
C'est pas bien de retirer sa clef quand le système accède au disque...
Mais bon ça m'est arrivé aussi...
Donc , j'ai fait des recherche et franchement j'ai pas trouvé grand chose de fonctionnel sous windows...
Par contre, dans mon cas, là ou windows ne reconnaissait plus ma clef, linux, lui, en était tout a fait capable... (je tourne suis nunux au boulot)
Donc ce que je te suggère, c'est de télécharger un livecd de linux, de reformatter ta clef a partir de cet os et normalement elle sera comme neuve.
Avec un peu de chance, tu pourras même récupérer tes données.
Distribution linux la plus connue:
Ubuntu
Outil de partition utilisé dans cette distribution
Gparted